Организация E. coli, как основа биотехнологической биоинформатики, в концепции системы взглядов супрамолекулярной биохимии

Вернуться к списку статей
Доклады Башкирского университета. 2018. Том 3. № 4. С. 411-415.

Авторы

Иванова Э. А.*
Уфимский институт биологии УФИЦ РАН
Россия, Республика Башкортостан, 450054 г. Уфа, проспект Октября, 69
Вафина Г. Х.
Уфимский институт биологии УФИЦ РАН
Россия, Республика Башкортостан, 450054 г. Уфа, проспект Октября, 69
Иванов Р. С.
Уфимский институт биологии УФИЦ РАН
Россия, Республика Башкортостан, 450054 г. Уфа, проспект Октября, 69
Тропынина Т. С.
Уфимский институт биологии УФИЦ РАН
Россия, Республика Башкортостан, 450054 г. Уфа, проспект Октября, 69

Абстракт

Впервые, на популяционном уровне жизненных циклов E.coli, рассмотрена динамика протеомной сети Арг-Х протеазо-процессинга в топологически-ассоциированных ансамблях супраструктурных блоков (ТААСБ) . Эта информация необходима для качественной конформационной оценки состояния системы и ее характеристики в коадаптивной ассоциации генофонда популяции, в которой существуют специфические элементы нековалентных взаимосвязей ТААСБ. Предложенный супрамолекулярный биохимический подход может дать информацию устойчивости (резистентности) по отношению к внешним и внутренним воздействиям в использовании системы для биоинформатики и биотехнологии.

Ключевые слова

  • топологически-ассоциированные супрамолекулярные ансамбли
  • Арг-Хпротеазо-процессинг

Литература

  1. Гельфанд М. С. Эволюция регуляторных систем // Материалы докладов V съезда биофизиков России. 2015. Ростов-на-Дону: издательство южного федерального университета. Т.1. С. 19.
  2. Иванова Э. А. Фракционирование растительных гистонов на колонках с амберлитом IRC-50. Сборник материалов третьей научной конференции молодых ученых // Уфа, 1972, С.54-55.
  3. Иванова Э. А., Вафина Г. Х. Способ получения ядерных протеиназ из негистоновых и гистоновых белков растений//Патент РФ №2518115
  4. Иванова Э. А. Вафина Г. Х., ТропынинаТ. С. Способ получения фракции из клеток E. coli, обладающей протеолитической активностью //Патент РФ №2410428.
  5. Иванова Э. А. Вафина Г. Х., Тропынина Т. С. Способ получения фракции из клеток Escherichiacoli, обладающей ингибирующей протеазы активностью // Патент РФ №2437934.
  6. Иванова Э. А., Вафина Г. Х., Тропынина Т. С. Способ анализа процесса Арг-Х протеолиза в положительно заряженных фракциях белков супрамолекулярных структур в растущей популяции Escherichiacoli // Патент РФ №2480523.
  7. Иванова Э. А., Вафина Г. Х., Тропынина Т. С. Способполучения положительно заряженных белковых фракций с ингибирующей в отношении трипсина активностью в растущей популяции Escherichiacoli // Патент РФ №2487940.
  8. Иванова Э. А., Вафина Г. Х., Тропынина Т. С. Способ препаративного выделения основных белков из надмолекулярных структур растущей популяции Escherichiacoli// Патент РФ №2471873.
  9. Иванова Э. А., Вафина Г. Х., Тропынина Т. С. Способ определения гексоз в супрамолекулярных структурах клеток Escherichiacoli // Патент РФ №2510846.
  10. Лен Ж-М. Супрамолекулярная химия: Концепции и перспективы: Пер. С анг. Новосибирск: Наука, 1998. 334с.
  11. Патрушев Л. И. Экспрессия генов. М. Наука. 2000. С.830.
  12. Разин С. В. , Гаврилов А. А., Кос П., Ульянов С. В. Самоорганизация хромиатиновой фибриллы в топологически-ассоциированные домены // Биоорганическая химия. 2017. Т. 43. С. 115-23.
  13. Стид Дж. В., Этвуд Дж., Л. Супрамолекулярная химия (Супрамолекулярная биохимия). М.: ИКЦ «Академкнига», 2007, Т. 2, 416с.
  14. Том Р. Структурная устойчивость и морфогенез. М.: Логос, 2002. 280 с.
  15. Хмель И. А. Регуляция экспрессии бактериальных генов в отсутствие активного роста клеток // Генетика, 2005, Т. 41, С. 1183-1202.

The organization of E. coli, as the basis of biotechnological bioinformatics, in the concept of the system of views of supramolecular chemistry

Authors

Ivanova E. A.*
Ufa Institute of Biology of the Ufa Scientific and Technical Center of the Russian Academy of Sciences
69 Oktyabrya Avenue, 450054 Ufa, Republic of Bashkortostan, Russia
Vafina G. H.
Ufa Institute of Biology of the Ufa Scientific and Technical Center of the Russian Academy of Sciences
69 Oktyabrya Avenue, 450054 Ufa, Republic of Bashkortostan, Russia
Ivanov R. S.
Ufa Institute of Biology of the Ufa Scientific and Technical Center of the Russian Academy of Sciences
69 Oktyabrya Avenue, 450054 Ufa, Republic of Bashkortostan, Russia
Tropynina T. S.
Ufa Institute of Biology of the Ufa Scientific and Technical Center of the Russian Academy of Sciences
69 Oktyabrya Avenue, 450054 Ufa, Republic of Bashkortostan, Russia

Abstract

First, at population level of life cycles of E. coli , the dynamics of proteom network of Arg-Х of protease-processing is considered in the topological-associated ensembles of superstructure blocks (TAESB). This information is needed for the quality conformation estimation of the state of the system and her description in the co-adaptive association of gene pool of population there are specific elements of uncovalently intercommunications of TAESB in that. Offer supramolecular biochemical approach can give information to stability (resistance) in relation to external and internal influences in the use of the system for a bioinformatics and biotechnology.

Keywords

  • topologically associated supramolecular ensembles
  • Arg-X protease processing
Вернуться к списку статей